數據清洗—【trim_galore】那些事

Trim Galore是對FastQC和cutadapt的包裝。適用於所有高通量測序，包括RRBS(Reduced Representation Bisulfite-Seq )、 Illumina、N ...

3.測序SRA數據下載與轉換

一、官方下載工具Sratoolkit安裝 　　推薦使用conda直接安裝，避免配置環境的麻煩，但sratoolkit在conda鏡像中的包名為sra-tools 二、SRA文件 ...

5.基因組索引文件創建—STAR

1.腳本 2.參數說明 3.注意事項 　網上有評論說明STAR建立索引文件十分占用系統資源，利用slurm集群運算時可通過調整向系統尋求的資源數量避免該問 ...