依據SNP染色體和位置信息批量轉換rs編號
如果只有SNP的染色體和物理位置信息，該如何批量轉換得到 rs ID？ 思路非常簡單，只需要下載 dbSNP 的參考文件，根據位置信息從參考文件中獲取對應的 rs 編號即可。 下面列舉兩個例子。 重命名 PLINK 文件 SNP 名字 第一個例子是 PLINK 格式的文件，要把 ...
原文：一行命令批量修改染色體和位置為RS號
鑒於太多人問我怎么批量根據chr:pos查找RS號，在這里出一個教程。 注意以下教程展示的是修改hg 基因組版本的RS號，如果你的數據是其他版本的，請修改為對應版本的數據。 假定數據是test.txt，內容如下： 現在希望根據第一列chr:pos找到對應的RS號，實現以下的效果： 則可以用dplyr::left join參數，具體實現過程如下所示： 上述命令需要用到snp hg .txt文件，其內 ...
2021-11-30 21:04 9 1764 推薦指數：
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