FASTA/Q序列處理神器---seqkit
該軟件對於處理FASTA/Q十分方便，省去自己編寫腳本 安裝 使用 序列操作（seq） Fasta/q之間以及與tab格式互換 序列信息統計 ...
原文：seqkit | 序列處理利器 | fastq | fasta | barcode提取 | Cell Ranger | 熒光標記比對
有時候需要個性化處理原始序列，自己寫python腳本太慢，且速度太慢，可以用seqkit這個工具，開發得不錯。 年 月 日 另一個需求：需要從Cell Ranger處理后的bam文件里提取出未比對的reads，然后再去比對到YFP序列上，確定每個細胞是否被YFP標記了。 參考 ：Cell Ranger的bam文件的解讀Barcoded BAM The cellranger pipeline out ...
2021-10-18 18:14 0 126 推薦指數：
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