視頻 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 ...
核心概念 Splice Site SS 位於外顯子與內含子的交界處,能夠被剪接體 spliceosome 識別的內含子序列。 分為 ss donor site ss acceptor site 。 ss中的 指的是 intron ss中的 指的是 intron Branching Point BP 位於內含子 ss上游 nt內 的部分保守序列,在剪接過程中能與 ss結合形成分支。 Note. Fr ...
2021-08-04 11:10 0 106 推薦指數:
視頻 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 ...
單細胞轉錄組確實是利器,但我們大多只利用了表達的信息,而從reads到表達之間的信息完全被我們忽略了。 最近nature發了一篇單細胞方法類文章,講得就是如何利用RNA velocity來做細胞發育路徑的推斷。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...
可變剪切的預測已經很流行了,目前主要有兩個流派: 用DNA序列以及variant來預測可變剪切;GeneSplicer、MaxEntScan、dbscSNV、S-CAP、MMSplice、clinVar、spliceAI 用RNA來預測可變剪切;MISO、rMATS、DARTS ...
冷凍電鏡 為什么冷凍電鏡 (Cryo-EM) 技術的發明可以獲得2017諾貝爾化學獎?知乎看法 Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2017 ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...
推薦關注微信公眾號:AIPuFuBio,和使用免費生物信息學資源和工具AIPuFu:http://www.aipufu.com。 【Circular RNA的產生機制】 Circular RNA,縮寫為circRNA,中文名為環狀RNA,屬於非編碼RNA,是近年的一個重要研究熱點 ...
scRNA-seq做完該做的QC、normalization、imputation、clustering、trajectory和integration,就會開始做轉錄調控的分析了。 核心就是圍繞着TF轉錄因子做文章 預測TF的靶基因 鑒定regulon 大部分都是高通量的預測 ...
基本問題: RNA的起源、定位和意義 明確RNA的各種概念分類 各種RNA的基本結構和功能 意義 有一種學說:RNA是生命的起源。 先有雞(DNA)還是先有蛋(蛋白質),好像都不太可能,那有沒有可能先有RNA?橋接了DNA和蛋白質,RNA本身也是一種酶 ...