原文:RNA剪接及調控機制 | RNA splicing and its regulation

核心概念 Splice Site SS 位於外顯子與內含子的交界處,能夠被剪接體 spliceosome 識別的內含子序列。 分為 ss donor site ss acceptor site 。 ss中的 指的是 intron ss中的 指的是 intron Branching Point BP 位於內含子 ss上游 nt內 的部分保守序列,在剪接過程中能與 ss結合形成分支。 Note. Fr ...

2021-08-04 11:10 0 106 推薦指數:

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MIT molecular Biology 筆記8 RNA剪接

視頻 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 ...

Thu Oct 25 05:36:00 CST 2018 0 930
RNA velocity | RNA速率

單細胞轉錄組確實是利器,但我們大多只利用了表達的信息,而從reads到表達之間的信息完全被我們忽略了。 最近nature發了一篇單細胞方法類文章,講得就是如何利用RNA velocity來做細胞發育路徑的推斷。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...

Mon Aug 20 20:19:00 CST 2018 0 2390
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
Circular RNA的產生機制、功能及RNA-seq數據鑒定方法

推薦關注微信公眾號:AIPuFuBio,和使用免費生物信息學資源和工具AIPuFu:http://www.aipufu.com。 【Circular RNA的產生機制】 Circular RNA,縮寫為circRNA,中文名為環狀RNA,屬於非編碼RNA,是近年的一個重要研究熱點 ...

Thu Oct 03 05:54:00 CST 2019 0 565
轉錄調控 | Transcriptional Regulation | Regulon

scRNA-seq做完該做的QC、normalization、imputation、clustering、trajectory和integration,就會開始做轉錄調控的分析了。 核心就是圍繞着TF轉錄因子做文章 預測TF的靶基因 鑒定regulon 大部分都是高通量的預測 ...

Sat May 05 08:04:00 CST 2018 0 2580
初探RNA | RNA分類 | miRNA | lncRNA

基本問題: RNA的起源、定位和意義 明確RNA的各種概念分類 各種RNA的基本結構和功能 意義 有一種學說:RNA是生命的起源。 先有雞(DNA)還是先有蛋(蛋白質),好像都不太可能,那有沒有可能先有RNA?橋接了DNA和蛋白質,RNA本身也是一種酶 ...

Wed Dec 15 21:49:00 CST 2021 0 813
 
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