單細胞分析實錄(18): 基於CellPhoneDB的細胞通訊分析及可視化 (上篇)
細胞通訊分析可以給我們一些細胞類群之間相互調控/交流的信息，這種細胞之間的調控主要是通過受配體結合，傳遞信號來實現的。不同的分化、疾病過程，可能存在特異的細胞通訊關系，因此闡明這些通訊關系至關重要。 CellPhoneDB配有詳實的受配體數據庫，其整合了此前的公共數據庫，還會手動矯正，以得到 ...
原文：單細胞分析實錄(19): 基於CellPhoneDB的細胞通訊分析及可視化 (下篇)
在上一篇帖子中，我介紹了CellPhoneDB的原理 實際操作，以及一些值得注意的地方。這一篇繼續細胞通訊分析的可視化。 公眾號后台回復 獲取本次演示的測試數據，以及主要的可視化代碼。 所有的數據和結果文件均已打包，下載后直接就能跑下面的代碼畫圖。 下面的代碼可以繪制對稱熱圖 如果你不清楚為啥熱圖要沿着對角線對稱，可以看一下之前的推文 還可以用網絡圖表示互作關系的數量 代碼如下 氣泡圖 具體的互作 ...
2021-07-25 13:14 0 389 推薦指數：
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