一、CNV 簡介 拷貝數異常(copy number variations, CNVs)是屬於基因組結構變異(structural variation),根據大小可分為兩個層次:顯 微水平(microscopic)和亞顯微水平(submicroscopic)。顯微水平 ...
目錄 .安裝 .測試 .動植物群體檢測CNV 知名的拷貝數變異分析工具幾乎都是為人類變異檢測開發,對於動植物重測序分析有些尷尬。不過好在植物群體研究不必那么精細,用同樣的工具也可做分析。 地址:https: github.com abyzovlab CNVnator .安裝 建議直接用conda。 查看幫助: .測試 首先准備好數據,再利用一個小數據集,比如這里用一條染色體來測試一下流程。 准備 ...
2021-07-25 11:41 0 277 推薦指數:
一、CNV 簡介 拷貝數異常(copy number variations, CNVs)是屬於基因組結構變異(structural variation),根據大小可分為兩個層次:顯 微水平(microscopic)和亞顯微水平(submicroscopic)。顯微水平 ...
DNA拷貝數變異CNV檢測——基礎概念篇 一、CNV 簡介 拷貝數異常(copy number variations, CNVs)是屬於基因組結構變異(structural variation),根據大小可分為兩個層次:顯 微水平 ...
Step-1: Run varscan2 on normal-tumor-mpileup and make copy-number call.java -jar $varscan copynumber ...
前言 拷貝數變異(copy number variation ,CNV)是指基因組上某些大片段的拷貝數增加或減少,可分為缺失(deletion)和重復(duplication)兩種類型。CNV是一種基因組結構變異,可通過改變基因劑量和轉錄結構 ...
前言 SV(大片段結構變異)指在基因組水平上大片段的insertion,deletion,inversion,translocation,duplication等變異。 SV檢測分重測序部分和基因組部分,重測序又分二代測序數據和三代測序數據之分。每種分析方法用到 ...
地址,第二個是源地址,第三個是數據長度。 使用memcpy函數時,需要注意: 數據長度(第三個 ...
本文轉載於https://www.cnblogs.com/xia-weiwen/p/11255927.html memcpy函數簡介 memcpy函數是C/C++語言中的一個用於內存復制的函數,聲 ...
目錄 組裝策略 輔助技術 PacBio補充 流程 主要分析內容 組裝 評估 注釋 比較基因組 組裝策略 二代測序平台如Illumina、BGI,穩定可靠,數據質量高,成本低,讀長短。 三代測序平台 ...