原文:R繪圖(7): 把散點圖的點換成扇形

前幾天分析了一批單細胞TCR的數據,需要畫這樣一個圖: 行是不同的樣本,列是不同的T細胞類型,每一個位置點的大小表示T細胞的數目多少,並且還需要根據T細胞所屬的克隆型類型塗色。這個圖用來描述TCR是我自己構思的,之前沒有在文章中見過。好在畫圖工具是現成的,用的是余老師的scatterpie包。后台回復 即可獲取本文的測試數據。 . 導入測試數據 看一下數據格式 原始數據框有 個腫瘤樣本, 個T細胞 ...

2021-07-22 16:56 0 229 推薦指數:

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R繪圖-散點圖

散點圖是將所有的數據以的形式展現在直角坐標系上,以顯示變量之間的相互影響程度,的位置由變量的數值決定,每個對應一個 X 和 Y 軸坐標。 散點圖可以使用 plot() 函數來繪制,語法格式如下: plot(x, y, type="p", main, xlab, ylab, xlim ...

Fri Aug 20 03:02:00 CST 2021 0 261
R繪圖(3): 散點圖添加文本注釋

這里以火山圖為例進行說明,在轉錄組分析中,火山圖是很常見的一類圖,縱軸表示p_value,橫軸表示log (fold change)。單一的散點圖繪制很簡單,火山圖比較難處理的地方就是一些基因的注釋,基因越多,加文本注釋越困難,因為文字會堆在一起,看不清。 示例數據df1是轉錄組做差異表達后的部分 ...

Tue Mar 09 00:49:00 CST 2021 0 560
R繪圖 第十篇:繪制散點圖(高級)

散點圖用於描述兩個連續性變量間的關系,三個變量之間的關系可以通過3D圖形或氣泡來展示,多個變量之間的兩兩關系可以通過散點圖矩陣來展示。 一,添加了最佳擬合曲線的散點圖 使用基礎函數plot(x,y)來繪制散點圖,其中x和y是數值型向量,代表着圖形中的(x,y) abline ...

Thu Dec 27 17:01:00 CST 2018 0 9178
R繪圖 第五篇:繪制散點圖(ggplot2)

ggplot2包中繪制圖的函數有兩個:geom_point和 geom_dotplot,當使用geom_dotplot繪圖時,point的形狀是dot,不能改變的形狀,因此,geom_dotplot 叫做散點圖(Scatter Plot),通過繪制點來呈現數據的分布,對分箱的方法有兩種: ...

Fri Aug 03 22:52:00 CST 2018 0 20560
使用lattice進行高級繪圖-- lattice 包(核密度圖、箱線圖、散點圖、3D散點圖圖、散點圖矩陣)

使用lattice進行高級繪圖-- lattice 包 lattice包提供了用於可視化單變量和多變量數據的一整套圖形系統。許多用戶轉向使用lattice包是因為它能很容易地生成網格圖形。 網格圖形能夠展示變量的分布或變量之間的關系,每幅圖代表一個或多個變量的各個水平。 思考下面的問題:紐約 ...

Wed Aug 18 05:34:00 CST 2021 0 154
R繪圖 第九篇:繪制散點圖和氣泡圖(ggplot2)

繪制散點圖(scatterplots)使用geom_point()函數,氣泡圖(bubblechart)也是一個散點圖,只不過的大小由一個變量(size)來控制。散點圖潛在的最大問題是過度繪圖:當一個位置或相鄰的位置上出現有多個,就可能把繪制在彼此之上, 這會嚴重扭曲散點圖的視覺外觀 ...

Mon Aug 13 20:53:00 CST 2018 0 8492
 
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