名詞解釋 | Lead SNPs | credible SNPs | Polygenicity | Discoverability
GWAS catalog里面的snp可以稱作reported SNP lead SNPs 就是曼哈頓圖里每根柱子最頂上的那個SNP 考慮LD的話，就是從每個loci 里面，選出P最小的點 Lead SNPs做了fine mapping后就得到了causal SNPs ...
原文：使用 FUMA 鑒定 Independent SNPs 和 Lead SNPs
一 Independent significant SNPs 和 Lead SNPs 定義 Independent significant SNPs： P 值小於 e 的 SNP 位點，且 SNP 位點之間的 r lt . 注意，這里的 r 指的是 LD 的 r 值，不是相關性哦，別誤解了， . 也是我設定的，不同文獻給定的 r 值不一樣，主流設定是 . Lead SNPs： Independen ...
2021-06-19 02:16 0 157 推薦指數：
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