原文:HISAT2 下載和使用

HISAT 官網https: daehwankimlab.github.io hisat HISAT 下載 https: daehwankimlab.github.io hisat download Binaries Version: HISAT . . Release Date: Source https: cloud.biohpc.swmed.edu index.php s fE QCsX N ...

2021-06-10 21:34 0 1641 推薦指數:

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Hisat2 bowtie2比對結果解讀(Hisat2 Alignment summary)

RNA-seq數據的比對結果怎么解讀?網上有很多人問,這里做一個大致的總結。 Hisat2和bowtie2比對后產生的Alignment summary的格式是一樣的,如下: Alignment summary When HISAT2 finishes running, it prints ...

Sun Mar 11 01:34:00 CST 2018 0 6401
RNA-Seq基因組比對工具HISAT2

原文網址: http://blog.biochen.com/archives/337 HISAT2是TopHat2/Bowti2的繼任者,使用改進的BWT算法,實現了更快的速度和更少的資源占用,作者推薦TopHat2/Bowti2和HISAT的用戶轉換到HISAT2。官網:https ...

Thu Jul 19 23:07:00 CST 2018 0 1289
HISAT2,StringTie,Ballgown處理轉錄組數據

HISAT2,StringTie,Ballgown處理轉錄組數據 本文總閱讀量次2017-05-26 HISAT2,StringTie,Ballgown處理轉錄組數據思路如下: 數據質控 將RNA-seq的測序reads使用hisat2比對 samtools ...

Sat Nov 10 05:46:00 CST 2018 0 1422
HISAT2+StringTie+Ballgown安裝及使用流程

HISAT2+StringTie+Ballgown安裝及使用流程 2015年Nature Methods上面發表了一款快速比對工具hisat,作為接替tophat和bowtie的比對工具,它具有更快的比對速度和更高的比對率,最近把這個流程走完一遍,感覺優勢還是很明顯的。 一、HISAT2 ...

Sat Nov 10 05:51:00 CST 2018 0 3946
Valgrind下載、安裝和使用

下載 valgrind-3.15.0.tar.bz2 CSDN資源 百度網盤 提取碼: e7hf 安裝 使用 1、檢查是否有內存泄露 下圖顯示 [ 沒有error,warning,但是卻發生了內存泄露 ] ,因此,需要進行手動釋放 malloc 開辟的空間 ...

Thu Aug 22 00:46:00 CST 2019 0 807
 
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