單細胞分析實錄(8): 展示marker基因的4種圖形（一）
今天的內容講講單細胞文章中經常出現的展示細胞marker的圖：tsne/umap圖、熱圖、堆疊小提琴圖、氣泡圖，每個圖我都會用兩種方法繪制。 使用的數據來自文獻：Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune ...
原文：單細胞分析實錄(9): 展示marker基因的4種圖形（二）
在上一篇中，我已經講解了展示marker基因的前兩種圖形，分別是tsne umap圖 熱圖，感興趣的讀者可以回顧一下。這一節我們繼續學習堆疊小提琴圖和氣泡圖。 . 堆疊小提琴圖展示marker基因 相比於其他可視化形式，小提琴圖可以更直觀地展示某一類亞群的某一個基因的表達分布情況。我的marker基因一共選了 個，下面來畫圖： Seurat內置的VlnPlot函數可以直接畫， 其中pt.size ...
2021-03-02 22:25 0 946 推薦指數：
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