VMD可視化hdf5格式的分子坐標文件
技術背景 VMD是分子動力學模擬領域常用的一款可視化軟件，可以非常直觀方便的展示分子的運動過程。而VMD本身對展現的格式有一定的要求，如果不是常見的rst等類型的坐標文件的話，就需要自己手動去實現一個可視化的插件。這里我們介紹的是通過VMD來可視化hdf5格式的坐標文件——hdf5是量子化學領域 ...
原文：分子指紋相似度的可視化
rdkit有一個很炫酷的功能，那就是能可視化顯示兩個分子的相似性。 以下面兩個分子為例： 計算相似度 將相似度映射到分子圖像 結果如下： ...
2021-01-20 14:32 1 346 推薦指數：
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