單細胞分析實錄(16): 非負矩陣分解(NMF)檢測細胞異質性
相信做過腫瘤單細胞的小伙伴對這個分析並不陌生，如果多讀幾篇文獻，就能在CNS以及大子刊上面看到這個分析。 非負矩陣分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)是在矩陣中所有元素均為非負數約束條件之下的矩陣分解方法。 基本思想：給定一個非負矩陣V, NMF ...
原文：單細胞分析實錄(4): doublet檢測
最近Cell Systems雜志發表了一篇針對現有幾種檢測單細胞測序doublet的工具的評估文章，系統比較了常見的例如Scrublet DoubletFinder等工具在檢測准確性 計算效率等方面的優劣，以及比較了使用不同方法去除doublet后對下游DE分析 軌跡分析的影響。 現有的檢測方法，基本都會先構造出虛擬doublet，然后將候選droplet與這些虛擬doublet比較，很相似的那些 ...
2020-12-31 12:41 0 351 推薦指數：
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