scRNA-seq單細胞測序數據分析工具匯總
本文總結自一篇綜述： Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 單細胞分析分為兩個層次： cell level gene level Tools for the visualization ...
原文：scRNA-seq數據獲得（R包scRNAseq）
R bioconductor中的scRNAseq數據包是專門提供scRNA seq數據的包。 .Introduction scRNA seq包提供了一個方便的途徑來獲得公開的數據集，這些數據集是以SingleCellExperiment 格式存儲的。 查看表達數據矩陣： . Available data sets 可獲得的數據集可以分為兩類，第一類包含表達矩陣，由scRNAseq作者從每個實驗得到 ...
2021-01-06 17:21 0 629 推薦指數：
相關推薦
單細胞空間轉錄組 | scRNA-seq
實驗室馬上要開始做heart的單細胞空間轉錄組，需要提前了解一下基本的data。 廢話不多說，先把示例數據和教程跑一遍，找找感覺。 參考：Seurat4.0系列教程22：空間轉錄組的分析、可視化與整合 樣本制備 - 獲取高質量數據的前提 參考 ...
單細胞轉錄組測序技術(scRNA-seq)及細胞分離技術分類匯總
單細胞測序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在過去的十多年里，高通量測序技術被廣泛應用於生物和醫學的各種領域，極大促進了相關的研究和應用。其中轉錄組測序（RNA-seq）被廣泛應用於測定和描繪各類物種的基因或轉錄 ...
R語言seq()函數用法
1、seq() 用來生成一組數字的函數。 Usage： ## Default S3 method:seq(from = 1, to = 1, by = ((to - from)/(length.out - 1)),length.out = NULL, along.with = NULL ...
R自帶數據包
datasets（R自帶數據包） 作者：王彥博 作品來源：百度百科 precip #長度為70的命名向量 euro #歐元匯率，長度為11，每個元素都有命名 landmasses #48個陸地的面積，每個都有命名 rivers #北美141條河流長度 state.abb #美國50 ...
[轉]Wireshark抓包工具--TCP數據包seq ack等解讀
/ ---------------------------------------------------------------------------------------- 1、Wireshark的數據包詳情窗口，如果是用中括號[]括起來的，表示注釋，在數據包中不占字節2 ...
R語言-數據整形之plyr包
R語言中plyr包 前言 apply族函數是R語言中很有特色的一類函數，包括了apply、sapply、lapply、tapply、aggregate等等。這一類函數本質上是將數據進行分割、計算和整合。它們在數據分析的各個階段都有很好的用處。例如在數據准備階段，我們可以按某個標准將數據分組 ...
R語言-數據整形之dplyr包
R語言dplyr包 前言 2014年剛到, 就在 Feedly 訂閱里看到 RStudio Blog 介紹 dplyr 包已發布 (Introducing dplyr)， 此包將原本 plyr 包中的 ddply() 等函數進一步分離強化， 專注接受dataframe對象， 大幅提高了速度 ...