【GS模型】使用R包sommer進行基因組選擇的GBLUP和RRBLUP分析？
目錄 簡介 GS示例代碼 簡介 R包sommer內置了C++，運算速度還是比較快的，功能也很豐富，可求解各種復雜模型。語法相比於lme4包也要好懂一些。 建議查看文檔：vignette("v1.sommer.quick.start") 混合線性模型 ...
原文：【GS模型】全基因組選擇之rrBLUP
目錄 . 理論 . 實操 . rrBLUP包簡介 . 實操 . 補充說明 關於模型 關於交叉驗證 參考資料 . 理論 rrBLUP是基因組選擇最常用的模型之一，也是間接法模型的代表。回顧一下，所謂間接法是指：在參考群中估計標記效應，再結合預測群的基因型信息將標記效應累加，最終獲得預測群的個體估計育種值。而直接法則是指：將個體作為隨機效應，參考群體和預測群體遺傳信息構建的親緣關系矩陣作為方差協方差 ...
2020-12-09 17:01 0 948 推薦指數：
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