原文:使用GenVisR包進行驅動突變的熱圖繪制

使用GenVisR包進行驅動突變的熱圖繪制 介紹 通過熱圖顯示突變的整體情況 代碼講解 加載包,讀入數據 它的輸入數據 drivers lung.txt 部分如下 代碼如下 這里用GenVisR包的waterfall函數進行突變的瀑布圖繪制.。mainLabelCol Changep 參數設置格子顯示里面的氨基酸變化。mainXlabel T添加x軸樣本名字標簽。mainPalette custo ...

2020-11-12 22:44 0 446 推薦指數:

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ComplexHeatmap 繪制腫瘤突變分布

來源:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ 安裝 7.2 Apply to cBioPortal dataset 通過使用實際數據展示oncoPring()的優勢。數據來源於cBioPortal。執行步驟 ...

Wed Sep 11 18:36:00 CST 2019 1 2164
ComplexHeatmap|根據excel表繪制突變景觀(oncoplot)

本文首發於“生信補給站”:https://mp.weixin.qq.com/s/8kz2oKvUQrCR2_HWYXQT4g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot繪制瀑布,有多種展示和統計maftools | 從頭開始繪制發表級oncoplot ...

Thu Jun 18 02:51:00 CST 2020 0 896
概率繪制--gradcam

代碼展示 Note:我是將自己的網絡訓練后保存模型,再加載未預訓練的Resnet50模型,再加載自己主干網絡的參數最后輸出提取的特征,這樣不用改動太多代碼 比較便捷的一點就 ...

Tue Dec 08 07:20:00 CST 2020 1 330
RNA_seq 繪制

若已經拿到表達矩陣exprSet 若差異較大,進行log縮小不同樣本的差距 1、全體 2、對差異基因進行繪制,步驟都類似,在進行繪制時,應對數據進行一定處理 3、rlog 進行數據標准化 標准化和raw count ...

Thu Feb 06 06:07:00 CST 2020 0 3588
pheatmap繪制”,你需要的都在這

可以聚合大量的數據,並可以用一種漸進色來優雅地表現,可以很直觀地展現數據的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語言 pheatmap 從頭開始繪制各種漂亮的。參數像積木,拼湊出你最喜歡的即可,如下圖: 基因和樣本都可以單獨聚類,排序,聚類再分組,行列注釋,配色 ...

Tue Jul 30 21:52:00 CST 2019 0 10680
使用python進行傅里葉變換FFT繪制頻譜

頻譜的橫軸表示的是 頻率, 縱軸表示的是振幅 #coding=gbk import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt #依據快速傅里葉算法得到信號的頻域 def test_fft ...

Fri Apr 24 00:03:00 CST 2020 0 5735
利用MATLAB繪制矩陣色塊

MATLAB自帶命令: h = heatmap(XVarNames, XVarNames, R_t) https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/ref/heatmap.html 屬性控制: https://ww2.mathworks.cn/help ...

Fri Jul 10 19:54:00 CST 2020 0 3003
更新-----為何使用lua進行

  事實上我們在安卓端是可以使用c#jit的,但是我們在ios上的代碼是AOT(預先編譯,靜態編譯)的,不能用c# jit(實時編譯,即時編譯)。   ios不能用c#更是因為啟動了CPU的No eXecute bit,簡單說就是ios不允許更改代碼,更新代碼必須重新提安裝進行審核 ...

Fri Nov 02 03:21:00 CST 2018 0 2502
 
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