在日常的科研中我們時不時的會聽到小伙伴們在討論那些關於測序的東西,什么高通量測序,二代測序,Sanger測序等等。今天我們就用最簡單的言語來講解一下這三種測序技術。 一代測序技術,也被稱為Sanger測序,其實是由一個叫Sanger的人發明的一種測序方式。其利用了雙脫氧核苷酸會終止PCR的原理 ...
三代測序 . 三代測序就是指單分子測序。 對於三代測序,存在多種定義。我們采用其中最簡單易懂的那種。此種定義之下的三代測序技術,原本三足鼎立,不幸最早出現的Helicos早早謝幕,后來雖有科學家出大力進行挽救,也沒有搶救成功,以致如今剩下Nanopore和PacBio雙雄並峙。 三代測序的簡要歷史發展進程如下: 年,Helicos Bioscience公司推出世界上第一款單分子測序平台,名叫Hel ...
2020-09-21 18:09 0 809 推薦指數:
在日常的科研中我們時不時的會聽到小伙伴們在討論那些關於測序的東西,什么高通量測序,二代測序,Sanger測序等等。今天我們就用最簡單的言語來講解一下這三種測序技術。 一代測序技術,也被稱為Sanger測序,其實是由一個叫Sanger的人發明的一種測序方式。其利用了雙脫氧核苷酸會終止PCR的原理 ...
第三代測序技術是指單分子測序技術,在測序過程中不需要涉及PCR擴增,實現了對每一條DNA分子的單獨測序。三代測序技術具有超長讀長,還擁有不需要模板擴增、運行時間較短、直接檢測表觀修飾位點、較高的隨機測序錯誤等特點。它彌補了第二代測序讀長短、受GC含量影響大等局限性,已在小型基因組從頭測序和組裝中有 ...
一、測序原理 先介紹 Nanopore 測序中的幾位主角: Reader :在自然界中,有一種可以嵌入到細胞膜中作為離子或分子通道的跨膜蛋白,具有天然的蛋白納米孔。經過人為基因工程修飾后,得到的就是 Nanopore 測序所需的 Reader 蛋白。 Membrane:Reader 蛋白 ...
之前總結的有關Pacbio RSII測序數據QC的一些基本知識。 Part 1. 下機數據 用一個下機數據作為示例: 在analysis文件夾中,下機的數據被分割為三個文件進行存儲,其中以bax.h5為后綴的是原始二進制文件;以subreads.fasta ...
“三代轉錄組”是什么?對於混跡在科研領域的一員,如果現在還不了解全長轉錄組測序,恐怕都不好意思說自己了解高通量測序了呢! 今天小編總結了一些三代全長轉錄組測序的相關問題,給大家來一個詳細全面的解釋,希望可以幫到愛學習的您哦! 1.什么是三代全長轉錄組測序 三代全長轉錄組測序,即利用 ...
這些三代全長轉錄組測序的相關問題,可以幫到愛學習的我哦 1.什么是三代全長轉錄組測序 三代全長轉錄組測序,即利用PacBio三代測序平台對某一物種的mRNA進行測序研究。它以平均超長讀長10-15kb的優勢、結合多片段文庫篩選技術,實現了無需拼接的轉錄本分析,克服了傳統二代轉錄 ...
基因組裝配工具Falcon工作流程 1 Falcon簡介Falcon (Fast Alignment and CONsensus),是由PacBio(太平洋生物科技公司)新開發的二倍體基因組從頭拼接 ...
三代測序及基於三代數據的基因組組裝流程評估 2018-04-04 12:13 名詞解釋 1D:ONT平台僅測一個DNA分子的一條鏈,測序通量比2D高但准確率低於2D序列。 2D:bi-directional reads即ONT平台測DNA分子的正負兩鏈 ...