GSEA-基因集富集分析
1.為什么寫？ 網上教程一抓一大把，有的能重復，有的不能重復不了，很多原因。別人能做的不代表你能復制，實踐出真知。 不做搬運工，只寫有用的，防止以后忘記。每個人理解不同，記錄下來，供自己今后參考，順便分享他人。 2.GSEA基本概念 Gene Set Enrichment ...
原文：基因或蛋白富集分析，gsea與ssgsea
大家應該對通路富集分析都很熟悉，如DAVID 超幾何富集分析等。都是在大量文章中常見的通路富集方法，給大家介紹一個更加復雜的通路富集分析的前期數據處理包GSVA gene set variation analysis 與gsea選擇。GSVA是一種非參數的無監督分析方法，主要用來評估芯片核轉錄組的基因集富集結果。主要是通過將基因在不同樣品間的表達量矩陣轉化成基因集在樣品間的表達量矩陣，從而來評估不 ...
2020-07-05 12:40 0 4712 推薦指數：
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