基因表達式編程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科學家Candida Ferreira 2001年提出來的一種新型遺傳算法,其特點是將基因型和表現型分離。GEP 繼承了GA的快速、易用和GP的易變、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...
做RNA seq的數據分析,一直弄不清楚實驗過程,最近有時間就找一些資料來了解一下,同時將整理的資料記錄下來,方便以后查找。 來源資料: D演示 基因的表達 原版 字幕版 人體從食物中獲取營養的過程也就是化學消化過程,是通過酶對食物進行分解來得到營養物質。DNA用來制造酶和各種蛋白質。DNA包含基因,基因是一段連續的核苷酸序列,這個序列包含一個區域編碼供RNA分子進行轉錄。 編碼區域從啟動子開始, ...
2020-06-23 16:11 0 1411 推薦指數:
基因表達式編程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科學家Candida Ferreira 2001年提出來的一種新型遺傳算法,其特點是將基因型和表現型分離。GEP 繼承了GA的快速、易用和GP的易變、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...
做了好久的RNA-seq分析,基因表達也在口頭溜了幾年了,但似乎老是浮在表面。 對一件事的了解程度決定了你的思維深度,只想做技工就不用想太多,想做大師就一定要刨根問底。 老是說基因表達,那么什么是基因表達?我們測序得到的基因表達其實只是一種表型,是樣本的一個快照,和普通的身高體重之類的連續型 ...
做單細胞RNA-seq分析,自然就能想到我們測到的其實是一個概率學的東西,就像女士品茶里的酵母的泊松分布一樣。 真實的細胞里,一切都是連續的,從DNA到mRNA到蛋白,是有一個時間間隔的,每一個pr ...
#http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2881355/ 一致聚類方法,采用重抽樣方法來驗證聚類合理性。 library(ALL)data(ALL)d=exprs(ALL)d[1:5,1:5] #對上面這個芯片表達數據我們一般會簡單的進行 ...
接前一篇: 用R和BioConductor進行基因芯片數據分析(五):芯片間歸一化 經過一系列的預處理,包括缺失值填充,中位數計算以及歸一化,我們的數據終於可以用啦。 下面我們就來分析一下new population和old population的個體是否有差異表達基因。 判斷一個基因是否 ...
這篇文章更多的是對於混亂的中文資源的梳理,並補充了一些沒有提到的重要參數,希望大家不會踩坑。 1. 簡介 1.1 背景 WGCNA(weighted gene co-expression network analysis,權重基因共表達網絡分析)是一種分析多個樣本 ...
利用建立分級樹對酵母基因表達數據進行聚類分析 一、原理 根據基因表達數據,得出距離矩陣 ↓ 最初,每個點都是一個集合 每次選取距離最小的兩個集合,將他們合並,然后更新這個新集合與其它點的距離 新集合與別的集合距離的計算方法 ①兩個集合之間的最短 ...
image Gene Set Enrichm ...