使用Aspera (ascp 命令)從NCBI高速下載數據
1. 簡介 生物信息研究人員往往需要從NCBI/sra 或者EBI/ENA下載高通量的測序數據。而通過NCBI申請獲得的數據往往需要通過Aspeara進行下載。 2. Aspeara 安裝 $ wget http://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net ...
原文：使用aspera從EBI下載fastq數據
前面我們大量NGS相關教程視頻免費發布在B站，都是使用NCBI的SRA數據庫下載sra文件后轉為fastq進行NGS分析流程，其實是因為我本人一直不在中國大陸，所以沒有網絡問題。但是學生們不一樣，同樣的命令他們prefetch的下載比蝸牛還慢，即使加上aspera后也會面臨sra文件轉為fastq的限速。所以我們在全國巡講的答疑群給大家指點的解決方案是使用aspera從EBI下載直接fastq數 ...
2020-07-30 10:42 0 1124 推薦指數：
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