原文:【R方差分析】蛋白質表達量多組比較

初始數據類似: 蛋白質組數據雖不是嚴格的正態分布,但目前最常用的檢驗方法還是T檢驗 兩組比較 和方差分析 多組比較 。這個話題值得深究,這里不展開。 主要是求多個蛋白的Pvalue值或FDR,用於差異篩選。 ...

2020-06-16 17:09 0 718 推薦指數:

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蛋白質組學實驗設計、質控與分析

1. 實驗設計與技術路線 (1) 常用流程 流程 說明 1.材料收集 細胞、細胞上清、組織、血漿、血清、腦脊液、外泌體、尿液...... 2.定量技術 蛋白組:iTRAQ/TMT ...

Thu Jan 16 05:19:00 CST 2020 0 2942
R語言構建蛋白質網絡並實現GN算法

R語言構建蛋白質網絡並實現GN算法 目錄 R語言構建蛋白質網絡並實現GN算法 1.蛋白質網絡的構建 2.生物網絡的模塊發現方法 3.模塊發現方法實現和圖形展示 1) 基於點連接的模塊發現 ...

Mon Sep 23 06:35:00 CST 2019 0 1222
蛋白質組學數據分析——(1)原理

當前,關於高通量蛋白質組學的研究遠不如NGS這般火熱,網上關於這方面的知識也寥寥無幾,從事這一行也有一段時間了,但還沒好好總結過。加之過段時間可能要去做培訓,所以是時候把知識點總結一下,權當復習。當然整個蛋白質組學研究也算紛繁復雜,不可能面面俱到,而且很多東西我也在學習當中,肯定會出現不少紕漏 ...

Thu Jul 18 06:59:00 CST 2019 1 9679
R語言-方差分析

方差分析指的是不同變量之間互相影響從而導致結果的變化 1.單因素方差分析:   案例:50名患者接受降低膽固醇治療的葯物,其中三種治療條件使用葯物相同(20mg一天一次,10mg一天兩次,5mg一天四次),剩下的兩種方式是(drugE和drugD),代表候選葯物      哪種葯物治療降低 ...

Sun Feb 18 07:19:00 CST 2018 0 1536
R語言——方差分析

一、方差分析的基本概念 方差分析是在20世紀20年代發展起來的一種統計方法,它是由英國統計學家費希爾在進行實驗設計時為解釋實驗數據而首先引入的。 從形式上看,方差分析比較多個總體的均值是否相等;但是其本質上是研究變量之間的相互關系。方差分析主要用於研究一個數值因變量與一個或多個分類自變量 ...

Mon May 22 23:58:00 CST 2017 0 1821
蛋白質結構模建初探

目錄 相關鏈接 蛋白質模建的幾種方法 同源模建 折疊識別 從頭預測 綜合方法 實地操作&預測結果 路線 預測結果 Swiss ...

Fri Apr 17 07:19:00 CST 2020 0 592
蛋白質基因組】Proteogenomics方法介紹及分析思路

概念 利用蛋白質組學數據,結合基因組數據(DNA)、轉錄組數據(RNA)來研究基因組注釋問題,被稱為蛋白質基因組學。“蛋白質基因組學”一詞由Jaffe 等於2004 年首次提出,作者采用串聯質譜數據匹配DNA翻譯得到氨基酸序列的方法,在僅有810 kb 大小的細菌基因組上直接鑒定開放閱讀框 ...

Tue Mar 10 06:49:00 CST 2020 0 1302
 
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