使用XP-CLR檢測基因組中的選擇信號
檢測基因組選擇信號的方法有很多種，其中 XP-CLR 方法是常用的一種。XP-CLR 是陳華老師、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年發表的方法，全稱叫 the cross-population composite likelihood ratio test ...
原文：使用Python版XP-CLR檢測基因組中的選擇信號
上一篇文章 使用XP CLR檢測基因組中的選擇信號 介紹了 XP CLR。XP CLR 是一種是基於選擇掃盪 selective sweeep 的似然方法。選擇掃盪可以增加群體之間的遺傳分化，導致等位基因頻率偏離中性條件下的預期值。XP CLR 利用了兩個群體之間的多基因座等位基因頻率差異 multilocus allele frequency differentiation 建立模型，使用布朗運 ...
2020-06-13 19:50 0 598 推薦指數：
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