#!/usr/bin/env python3#!-*- coding:UTF-8 -*- ...
背景 Kmer是基因組組裝算法中經常接觸到的概念,簡單來說,Kmer就是長度為k的核苷酸序列。一般長短為m的reads可以分成m k 個Kmer。Kmer的長度和閾值直接影響到組裝的效果。 Denovo組裝流程:原始數據 數據過濾 糾錯 kmer分析 denovo組裝。 組裝測序策略:根據基因組大小和具體情況選擇個大概的k值,構建contig所需的數據量以及所需的構建的文庫數量。對於植物基因組一般 ...
2020-05-13 15:28 0 717 推薦指數:
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寫程序我們經常會遇到需要遍歷某一個目錄下的所有文件這個操作,之前也寫過很多用java實現的。但是java里面只能獲取當前目錄下列表,然后需要循環判斷哪些是目錄,哪些是文件,然后再進行文件夾的循環遍歷,可以說相當麻煩。然而python有現成的庫,只需要2個循環就可以搞定 ...
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使用os.listdir() 函數來獲取某個目錄中的文件列表 import os names = os.listdir('somedir') 結果會返回目錄中所有文件列表,包括所有文件,子目錄,符號鏈接等等。如果你需要通過某種方式過濾數據,可以考慮結合os.path 庫 ...
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原文地址: https://blog.csdn.net/Scythe666/article/details/90262029 ...
#自定義函數: import ospath="D:\\Temp_del\\a"def gci (path): """this is a statement""" parents = os.listd ...