對GWAS的summary文件進行整合時,經常需要在beta,or, se, p, zscore之間進行換算,故在此總結一下。希望對大家有幫助。 1. se 計算 1.1 有 beta、p ,計算se; se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F ...
p value換算成zscore公式如下: pvalue就是P值,c就是zscore的絕對值。如果想知道zscore的正負,需要看or或者beta的值。如果or大於 beta大於 ,zscore為正值,如果or小於 beta小於 ,zscore為負值 如果自己懶得用公式計算,也可以利用ldsc計算zscore,具體參考鏈接:https: www.cnblogs.com chenwenyan p . ...
2020-05-07 16:50 0 1067 推薦指數:
對GWAS的summary文件進行整合時,經常需要在beta,or, se, p, zscore之間進行換算,故在此總結一下。希望對大家有幫助。 1. se 計算 1.1 有 beta、p ,計算se; se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F ...
1. 有 beta、p ,計算se; 公式為:se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F)) 2. 有 or、p ,計算se; 公式為:se=abs(log(or)/qnorm(p/2)) 此外, beta等同於log(or); qnorm ...
z檢驗: 計算臨界值:scipy.stats.norm.ppf(level_of_confidence) 計算p值:scipy.stats.norm.sf(abs(z_score)) 或 1-scipy.stats.norm.cdf(abs(z_score))---左尾或右尾,雙尾檢驗需 ...
當我們說到p-value時,我們在說什么? “這個變量的p-value小於0.05,所以這個變量很重要” ........ 你真的知道自己在說什么么???這個p-value到底是個什么鬼?為什么小於0.05就很重要?很重要是什么意思????? 終於... 這次 ...
當我們說到p-value時,我們在說什么? “這個變量的p-value小於0.05,所以這個變量很重要” ........ 你真的知道自己在說什么么???這個p-value到底是個什么鬼?為什么小於0.05就很重要?很重要是什么意思????? 終於... 這次,我們通俗易懂地來講講 ...
p-value是一種概率:在原假設為真的前提下,出現該樣本或比該樣本更極端的結果的概率之和。 例子: 我們假設 H0:出現正面的概率是1/2 扔硬幣20次出現了14次正面.該樣本的單邊p-value計算如下: 考慮雙邊檢驗時候,p-value是單邊 ...
版本: Python=3.7 TensorFlow=1.14 具體代碼: 報錯: Attempting to use uninitialized value beta2_power 查找資料 ...
頻數沒有差異,或者兩個變量相互獨立不相關。 實際應用中,我們先假設原假設成立,計算出卡方值,卡方表示觀察 ...