做醫學圖像時,SimpleITK是一個很常用的庫。實際上大家往往喜歡把不同類型的數據割裂開,nrrd用pynrrd處理,dicom用dicom處理,nii用nibabel處理……實際上根本沒必要,SimpleITK完全可以統一處理,各種類型的讀取和保存一步搞定。 1. 讀取 首先是 ...
SimpleITK 和 Nibabel 區別在於: nii圖像可以看成 維,也可以看成三維 SimpleITK讀取數據是 X,Y,Z 顯示,Nibabel讀取圖像是 Z,Y,X 顯示,也就是Nibabel加載的圖像會旋轉 ,其中X表示通道數,即切片層數。詳情 SimpleITK圖像: ...
2020-03-21 14:54 0 3259 推薦指數:
做醫學圖像時,SimpleITK是一個很常用的庫。實際上大家往往喜歡把不同類型的數據割裂開,nrrd用pynrrd處理,dicom用dicom處理,nii用nibabel處理……實際上根本沒必要,SimpleITK完全可以統一處理,各種類型的讀取和保存一步搞定。 1. 讀取 首先是 ...
1.下載工具包。 Tools for NIfTI and ANALYZE image 2.下載完解壓,移動到matlab toolbox中,添加路徑,更新工具包緩存 3.調用load_nii即可 ...
通常我會用simpleitk來讀取dicom文件,主要是為了將dicom文件轉換為numpy矩陣,便於輸入神經網絡,讀取dicom文件可分為兩種情況,一.單獨的dicom文件 二.一系列dicom文件,前者只是一張切片,通常是X光片,后者是很多張切片,合在一起通常代表CT圖像。 一. 讀取 ...
醫療圖像是對解剖區域的內部結構和功能的一種表征。它以二維像素或者三維體素的形式呈現出來。映射到空間位置的數值是對采樣過程和重建過程的離散表征。用來描述一個確定采樣模態視野的像素數量是對解剖結構和功能的細節的表達。像素表達的數值取決於成像模式、采樣協議、重建以及后續處理過程。 醫療數據的組成 ...
創建日期: 2020-03-11 16:59:10 這兩天又重新回顧了一下醫學圖像數據的讀取和預處理方法,在這里總結一下。 基於深度學習做醫學圖像數據分析,例如病灶檢測、腫瘤或者器官分割等任務,第一步就是要對數據有一個大概的認識。但是我剛剛入門醫學圖像分割的時候,很迷茫不知道自己該干啥,不知道 ...
1、介紹 The Cancer Imaging Archive (TCIA)是癌症研究的醫學圖像的開放獲取數據庫。該網站由國家癌症研究所(NCI)癌症影像計划資助,合同由阿肯色大學醫學科學院管理。存檔內的數據被組織成通常共享癌症類型和/或解剖部位的“集合”。 通常是由常見疾病(例如肺癌),圖像 ...
這次教程中,我們將學會如何使用四邊形紋理貼圖把文字顯示在屏幕上。我們將把256個不同的文字從一個256×256的紋理圖像中一個個提取出來,接着創建一個輸出函數來創建任意我們希望的文字。 還記得在第一篇字體教程中我提到使用紋理在屏幕上繪制文字嗎?通常當你使用紋理繪制文字時你會調用你最喜歡的圖像 ...