原文:使用metaCCA進行單/多個SNP與多表型的典型相關性分析

歡迎來到 bio生物信息 的世界 新年的第一篇更文。 祝大家新春快樂 身體健康 號回家以后,經歷了如下過程。 號 喉嚨痛 號 喉嚨痛 號喉嚨痛 咳嗽 號 咳嗽 號 咳嗽為主 鼻塞 夜間咳嗽加劇 號 咳嗽為主 鼻塞 流鼻涕 夜間咳嗽加劇 號 咳嗽為主 鼻塞 流鼻涕 打噴嚏 夜間咳嗽加劇 號 咳嗽為主 鼻塞 流鼻涕 打噴嚏 夜間咳嗽加劇 換了多種葯物,均不見效。 索性也少關注新型病毒肺炎的事了,緩解些 ...

2020-01-28 16:07 7 1454 推薦指數:

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一次計算多個表型的遺傳相關性(LDSC, GCTA)

遺傳相關的計算之前介紹過幾次了,感興趣的翻之前的推文: 1、利用GCTA工具計算復雜性狀/特征(Complex Trait)的遺傳相關性(genetic correlation) 2、LD SCore計算基因多效、遺傳度、遺傳相關性 之前的兩篇推文均有一個小局限,就是針對多個表型間的遺傳 ...

Sat Oct 24 04:11:00 CST 2020 0 1091
使用R進行相關性分析

基於R進行相關性分析 一、相關性矩陣計算: [1] 加載數據:   >data = read.csv("231-6057_2016-04-05-ZX_WD_2.csv",header=FALSE) 說明:csv格式的數據,header=FALSE 表示沒有標題,即數據從第一 ...

Sat Sep 10 00:25:00 CST 2016 6 42396
相關性分析

相關性分析 相關性分析解決解決以下兩個問題: 判斷兩個或多個變量之間的統計學關聯; 如果存在關聯,進一步分析關聯強度和方向 雙變量相關系數 Pearson相關系數 用於度量兩個變量X和Y之間的相關程度(線性相關),其值介於-1與1之間,定義為兩個變量的協方差除以他們的標准差 ...

Wed Feb 10 21:39:00 CST 2021 0 874
相關性分析

corr 線性或等級相關 折疊全部頁面 句法 rho = corr(X) rho = corr(X,Y) [rho,pval] = corr(X,Y ...

Wed Apr 15 21:43:00 CST 2020 0 862
相關性分析

什么是相關性分析相關性分析研究現象之間是否存在某種依存關系,對具體有依存關系的現象探討相關方向及相關程度。 相關分析是一種簡單易行的測量定量數據之間的關系情況的分析方法。可以分析包括變量間的關系情況以及關系強弱程度等 有點類似於特征提取 常用的相關性分析方法 協方差及協方差矩陣 ...

Fri Oct 09 22:08:00 CST 2020 0 810
相關性分析 散點圖

import pandas as pddf2=pd.read_excel('./data/data2.xlsx',index_col='產品編碼')df2.head()x=df2['供應商進貨價']y ...

Fri Oct 04 04:03:00 CST 2019 0 887
pandas相關性分析

DataFrame.corr(method='pearson', min_periods=1) 參數說明: method:可選值為{‘pearson’, ‘kendall’, ‘spearman’} pearson:Pearson相關系數來衡量兩個數據集合是否 ...

Tue Apr 21 18:46:00 CST 2020 0 4310
matlab 相關性分析

Pearson相關系數 考察兩個事物(在數據里我們稱之為變量)之間的相關程度,簡單來說就是衡量兩個數據集合是否在一條線上面。其計算公式為: 或或 N表示變量取值的個數。 相關系數r的值介於–1與+1之間,即–1≤r≤+1。其性質如下: 當r>0時,表示兩變量 ...

Fri Jan 01 18:21:00 CST 2016 0 8671
 
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