1.使用clusterProfiler包進行GO富集分析 使用clusterProfiler的enrichGO函數來獲取GO分析 可以看到GO富集分析條目一共有769條屬於BP,51條屬於CC,32條屬於MF 2.ggplot2繪制GO分析條目圖 1. ...
參考博客 http: blog.sciencenet.cn blog .html 四個參數用於控制坐標軸與作圖區域的位置 scale x discrete expand c , scale y discrete expand c , scale x continuous expand c , scale y continuous expand c , 數據格式 自己作圖代碼如下 ...
2020-01-21 11:37 0 1685 推薦指數:
1.使用clusterProfiler包進行GO富集分析 使用clusterProfiler的enrichGO函數來獲取GO分析 可以看到GO富集分析條目一共有769條屬於BP,51條屬於CC,32條屬於MF 2.ggplot2繪制GO分析條目圖 1. ...
1.用qplot(x,data=data,geom.=”bar”,weight=y)+scale_y_continuous("y")畫出y關於x的條形。 圖中提示binwidth這里是指矩形的寬度,指定之后如下 2.用qplot(x,data=data,geom. ...
Excel中圖表如下: 今天折騰了大半天,在ggplot2中,要不是堆積圖要么就是非堆積的,沒法像Excel中做到分組堆積(也許有辦法,但我目前還不知道該如何實現-_-!) 只能是在R中做了個類似的,但問題很多。。。 R中圖形如下: 因為是模擬出來的,還沒法對A,B,C,D ...
使用geom_bar()函數繪制條形圖,條形圖的高度通常表示兩種情況之一:每組中的數據的個數,或數據框中列的值,高度表示的含義是由geom_bar()函數的參數stat決定的,stat在geom_bar()函數中有兩個有效值:count和identity。默認情況下,stat="count ...
位置調整(Position adjustments)是針對同一圖層內元素的位置進行微調的方法。它包括五種設置,分別是stack、dodge、fill、identity、jitter。 我們用條形圖來展示其用法,仍使用mpg數據集,其中用到的變量是class,即生產汽車的類型,以及year ...
散點圖是 KEGG 富集分析結果的圖形化展示方式。在此圖中,KEGG 富集程度通過 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因個數來衡量。其中 rich factor 指差異表達的基因中位於該 pathway 條目的基因數目與所有有注釋基因中位於該 pathway 條目的基因 ...
和R自帶的繪圖系統不同,ggplot2不能直接通過par(mfrow) 或者 layout()來排版多張圖片。終於發現,其實可以通過一個『gridExtra』包來搞定: Reference: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com ...
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