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.使用clusterProfiler包進行GO富集分析 使用clusterProfiler的enrichGO函數來獲取GO分析 可以看到GO富集分析條目一共有 條屬於BP, 條屬於CC, 條屬於MF .ggplot 繪制GO分析條目圖 .按照qvalue升序排序,分別選出前 個BP,CC,MF的條目,由於enrichGO函數生成的數據框默認是按照qvalue升序排序,所以這里我們只用選取前十個就 ...
2020-01-05 18:39 0 9465 推薦指數:
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參考博客 http://blog.sciencenet.cn/blog-3406804-1166293.html 四個參數用於控制坐標軸與作圖區域的位置 scale_x_discrete( ...
散點圖是 KEGG 富集分析結果的圖形化展示方式。在此圖中,KEGG 富集程度通過 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因個數來衡量。其中 rich factor 指差異表達的基因中位於該 pathway 條目的基因數目與所有有注釋基因中位於該 pathway 條目的基因 ...
## Gives count, mean, standard deviation, standard error of the mean, and confidence interval ...
如下代碼所示: ...
,統計出作圖的數據集 4.作圖 上面代碼解釋:在ggplot2中, 所接受 ...
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以下繪圖以Weibull分布(韋伯分布、威布爾分布)為例 關於Weibull分布(韋伯分布、威布爾分布),請參考本人博客http://www.cnblogs.com/wwxbi/p/6141501.html library(ggplot2) # 這里的d和y都有大小順序 d< ...