原文:GO分析-GOseq的使用教程

GOseq的介紹 GOseq是一個R包,用於尋找GO terms,即基因富集分析。此方法基於 Wallenius non central hyper geometric distribution。相對於普通的超幾何分布 Hyper geometric distribution ,此分布的特點是從某個類別中抽取個體的概率與從某個類別之外抽取一個個體的概率是不同的,這種概率的不同是通過對基因長度的偏好 ...

2019-12-30 22:11 0 2892 推薦指數:

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goseq

goseq是一個R包,用於尋找GO terms,即基因富集分析GO terms是標准化描述基因或基因產物的詞匯,包括三方面,cellular component,molecular funciton,biological process。 每個GO term都有一個GO ID,比如 GO ...

Thu Jul 20 05:27:00 CST 2017 0 1552
Go Modules使用教程

Go Modules 不完全教程 文章轉載自公眾號 Golang 成神之路 , 作者 L Go Modules 是 Golang 官方最近幾個版本推出的原生的包管理方式,在此之前,社區也不乏多種包管理方案。在討論 Go Modules 之前 ...

Wed Sep 18 06:53:00 CST 2019 3 12378
OS Tools-GO富集分析工具的使用與解讀詳細教程

我們的雲平台上的GO富集分析工具,需要輸入的文件表格和參數很簡單,但很多同學都不明白其中的原理與結果解讀,這個帖子就跟大家詳細解釋~一、GO富集介紹: Gene Ontology(簡稱GO)是一個國際標准化的基因功能分類體系,提供了一套動態更新的標准詞匯表(controlled ...

Sat Dec 15 19:16:00 CST 2018 0 4428
gin框架教程一: go框架gin的基本使用

gin框架教程代碼地址: https://github.com/jiujuan/gin-tutorial 我們在用http的時候一般都會用一些web框架來進行開發,gin就是這樣的一個框架,它有哪些特點呢 一:gin特點 1、性能優秀2、基於官方的net/http的有限封裝 ...

Sun Jun 11 01:08:00 CST 2017 0 1633
使用clusterProfiler進行GO富集分析

使用clusterProfiler進行GO富集分析原創weixin_43569478 最后發布於2018-11-05 10:06:43 閱讀數 12741 收藏展開歡迎關注微信公眾號《生信修煉手冊》! clusterProfiler是一個功能強大的R包,同時支持GO和KEGG的富集分析 ...

Sun Mar 22 22:53:00 CST 2020 0 1094
關於基因GO分析的DAVID簡單使用

利用DAVID簡單的進行GO富集度分析(這里只做簡單的分析,即看基因是否存在在GO的三個過程里面) 比如我們有一組要分析的基因:TRPV6 CXADR PROM1 GRAMD2 SOX10 GPRIN2 VANGL2 GRHL1 BCL11A ...

Sun Oct 01 02:47:00 CST 2017 0 9404
 
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