使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌
使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi Tian1, Gordon K. Smyth4 and Matthew E. ...
原文：使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌
Contents 摘要 背景介紹 初始配置 數據整合 . 讀入計數數據 . 組織樣品信息 . 組織基因注釋 數據預處理 . 原始數據尺度轉換 . 刪除低表達基因 . 歸一化基因表達分布 . 對樣本的無監督聚類 差異表達分析 . 創建設計矩陣和對比 . 從表達計數數據中刪除異方差 . 擬合線性模型以進行比較 . 檢查DE基因數量 . 從上到下檢查單個DE基因 . 差異表達結果的實用圖形表示 使用ca ...
2019-12-11 09:42 0 264 推薦指數：
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