deconstructSigs|探尋cosmic的獨特“氣質”-mutation signature ！
deconstructSigs-mutation signature看一下你的數據是什么“氣質”的？ 本文首發於“生信補給站” https://mp.weixin.qq.com/s/k7yzk9hPX3Bi-ohAo83ZYw 還有其他 R統計 繪圖 生信的干貨，也許有需要 ...
原文：結合自己做過的數據，對cosmic signature理解
分析WGS的mutation時，我用pyclone將mutations聚成了四類。我試圖解釋每一類的含義，比如：致病的變異 耐葯的變異 治療敏感的變異.... cosmic signature呢，每個樣本都有 個signature的信息，假設有 個樣本。用NMF或PCA將這些聚成了 類，即 個signatue。 然后，尋找每個signature與什么表型有關系。比如：已知aging的signatu ...
2019-11-21 11:18 0 277 推薦指數：
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