GC偏好的校正與偏好程度的評估
在二代測序儀上測出的數據，通常都會表現出測序深度與GC 含量的相關性，稱為GC bias。 GC bias校正 為了后續生物信息分析更加准確，通常需要做GC bias的校正。 2010 年 steven Quake 在Noninvasive diagnosis of fetal ...
原文：GC偏好
GC偏好 測序中的GC偏好指的是基因組上GC含量在 左右的區域更容易被測到，產生的reads更多，這些區域的覆蓋度更高， 在高GC或者低GC區域，不容易被測到，產生較少的reads，這些區域的覆蓋度更少。 用基因組單位長度的bin中的GC含量作為橫坐標，覆蓋度作為縱坐標作圖，可以明顯的看到該趨勢。這種趨勢在 kb為單位的bin中依然存在。如圖A中可以看出隨着GC含量的增加，counts是先增加后減 ...
2019-10-31 19:18 0 554 推薦指數：
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