「三代組裝」使用Pilon對基因組進行polish
文件 利用第二代數據和第三代數據進行混裝（Hybrid assembly），這種方法充分發揮了第 ...
原文：使用wtdbg利用三代數據進行基因組de novo組裝
相較於其他三代四代數據組裝軟件 Canu 也可用於糾錯 ，smartdenovo，miniasm，Flye，TULIP，FALCON，FALCON unzip等 wtdbg有如下優點： 安裝運行簡單 可用run wtdbg assembly.sh腳本生成運行腳本 ，運行速度快, 運行內容：一步組裝，兩輪糾錯 edge min 值對基因大小影響特別大，在基因組復雜度低和測序深度大的情況下可提高該值， ...
2019-10-18 09:56 0 937 推薦指數：
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考慮到cnblog不適合基因組領域這種類型的文章， 最終，我自己開通了公眾號：鹼基礦工，歡迎感興趣的同學關注！ 也可以關注我的知乎：https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改：這篇文章寫於2013年，首發 ...