這部分開始進行基本的富集分析,兩類 A:差異基因富集分析(不需要表達值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有無差異, ...
推薦關注微信公眾號:AIPuFuBio,和使用免費生物信息學資源和工具AIPuFu:http: www.aipufu.com。 Circular RNA的產生機制 Circular RNA,縮寫為circRNA,中文名為環狀RNA,屬於非編碼RNA,是近年的一個重要研究熱點。 CircRNA主要是通過backsplicing的方式產生,明顯不同於線性RNA linear RNA 經典的 的模式。因 ...
2019-10-02 21:54 0 565 推薦指數:
這部分開始進行基本的富集分析,兩類 A:差異基因富集分析(不需要表達值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有無差異, ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...
主要介紹如何分析RNA-seq 數據 參考文檔 Wikipedia-RNA-seq paper: RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics TopHat Cufflinks CummeRbund TopHat ...
簡單理解RNA-seq 劉小澤 已關注 2018.10.17 23:51* 字數 1518 閱讀 46評論 0喜歡 3 今天就當一個小故事看吧,看了statQuest,感覺講的很棒,於是分享給大家原版視頻后台回復 ...
A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq數據分析指南 內容 前言 各位同學/老師,大家好,現在由我給大家講講我的文獻閱讀報告! A survey of best practices ...
RNA的重要調控功能發現歷程(Rinn et al. Annu Rev Biochem, 2013) 長非編碼RNA,英文名為long noncoding RNAs,縮寫為lncRNA,是指長度大於200 核苷酸的非編碼RNA。LncRNA因具有非常重要 ...
SRA - NCBI example - NCBI 要發文章了,審稿時編輯肯定會要求你上傳NGS測序數據。 一般數據都是放在集群,不可能放在個人電腦上,因為有的數據大的嚇人(幾個T)。 所以我們就建一個文件夾,然后把所有需要的fastq文件鏈接到這個文件夾就行了(copy太慢,也太占空間 ...
Principal component analysis (PCA) 分析 主成分分析(PCA)幫助我們歸納總結和可視化數據集中的信息,這些數據包含由多個相互關聯的變量描述的個體 / 觀察主成分分析。 可以將每個變量視為不同的維度。 但如果您的數據集中有3個以上的變量,那么很難在多維超空間可視化 ...