原文:制作annovar注釋依賴的cosmic數據庫

. 文件准備 COSMIC相關文件下載 COSMIC更新了下載規則。以前直接用ftp可以下載,現在麻煩一些,要根據它們提供的指導規則下載。 以GRCh cosmic v VCF CosmicNonCodingVariants.vcf.gz的下載為例: 獲得授權字符 獲得下載鏈接 下載數據 從上一步返回的JSON中提取下載鏈接並直接下載 . 數據處理 ...

2019-09-20 10:13 0 401 推薦指數:

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如何用annovar下載數據庫

主要參考annovar官網 https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/startup/ 里面寫道 First, we need to download appropriate database ...

Wed Mar 10 22:31:00 CST 2021 0 408
數據庫注釋

Oracle 和 SQL Server:單行--這后邊就是注釋多行/*這里是注釋這里是第二行注釋*/ mysql 服務器支持如下幾種注釋方式: (1) # 到該行結束 # 這個注釋直到該行結束 mysql> SELECT 1+1; (2)-- 到該行結束 ...

Wed Nov 22 19:38:00 CST 2017 0 1133
Annovar 信息注釋

ANNOVAR 注釋軟件 ANNOVAR簡介 ANNOVAR結構 ANNOVAR下載數據庫 ANNOVAR輸入格式 ANNOVAR格式轉換 ANNOVAR注釋功能 用table_annovar ...

Sat Dec 30 00:13:00 CST 2017 0 2638
annovar 注釋除人類以外的SNP

1. 准備文件: ref.fa ref.gtf或者gff3,最好是gtf3,可將gff3轉化為gtf sample.vcf 2. 用gff3ToGenePred與gtfToGen ...

Tue Sep 03 20:06:00 CST 2019 0 358
數據庫添加注釋

sql server 添加表注釋、字段注釋--為字段添加注釋 --格式如右:execute sp_addextendedproperty 'MS_Description','字段備注信息','user','dbo','table','字段所屬的表名','column','添加注釋的字段名 ...

Thu Sep 26 17:23:00 CST 2019 0 403
緩存依賴(文件、數據庫

前言 緩存的基本用法介紹:我推薦看下 asp.net緩存 。 本篇,我主要寫下一般sql的緩存依賴,還有使用Mvc過濾器的數據庫緩存依賴。 什么是緩存依賴 1.緩存:是把你要訪問的資源,放在內存中,占用一定的內存空間,從而是用戶讀取內存中的數據,進而減少讀取數據庫,或資源文件的次數 ...

Mon Aug 11 23:59:00 CST 2014 18 17719
sql 給數據庫表 字段 添加注釋

最近發現一些代碼生成器 有針對注釋做一個很好的轉化,之前建表的時候 沒有這塊的注釋。現在想增加,專門去看了下 如何增加注釋 順便也記錄一下使用SQL給表的字段添加注釋的方法,方法如下: ...

Sun Jul 17 18:12:00 CST 2016 0 6331
Mybatis generator 生成domain字段帶數據庫注釋

由於目前准備開始的項目要用到Mybatis,所以不可避免的要使用Mybatis generator工具通過數據庫直接生成map,entity。但在使用過程中,原版的Mybatis generator有很多不足,每次啟動的時候還要單獨啟動,不能在eclipse里面通過插件啟動;不能把數據庫注釋寫入 ...

Mon Aug 29 04:14:00 CST 2016 0 3460
 
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