單細胞測序 Trajectory analysis 軌跡推斷
單細胞測序 Trajectory analysis 軌跡推斷細胞多樣性不能通過離散的分類系統（例如細胞聚類）充分描述。觀察到的細胞異質性發展的生物進程是一個連續過程（Tanay＆Regev，2017）。因此，為了捕獲細胞身份之間的過渡狀態、不同的分化分支或生物學功能的漸進式非同步變化，我們需要動態 ...
原文：基於單細胞測序數據構建細胞狀態轉換軌跡(cell trajectory)方法總結
細胞狀態轉換軌跡構建示意圖 Trapnell et al. Nature Biotechnology, 在各種生物系統中，細胞都會展現出一系列的不同狀態 如基因表達的動態變化等 ，這些狀態 state 之間會按照一定的時間順序轉換。最典型的比如細胞的分化過程，從不成熟的細胞逐漸分化為成熟細胞。此外，細胞在受到外界刺激或擾動時，細胞內基因的表達也可能發生一系列的變化，從而呈現出一系列狀態的轉換。 ...
2019-09-08 17:36 0 1017 推薦指數：
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