原文:查詢、下載GWAS目錄數據的R包(gwasrapidd)

目前GWAS方向發了很多文獻,但是並沒有一個很完善的R包對這些文獻的數據進行匯總。 接下來推薦的這個是最新發表的GWAS數據匯總R包 。看了一下功能齊全,但是數據不是收錄的很齊全 。 下面具體講一下。 在R上安裝 install.packages remotes remotes::install github ramiromagno gwasrapidd 查詢是否有發表關於自身免疫性疾病的文章 l ...

2019-08-28 21:26 0 429 推薦指數:

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R下載sra數據

1)介紹 我們用SRAdb library來對SRA數據進行處理。 SRAdb 可以更方便更快的接入 metadata associated with submission, 包括study, sample, experiment, and run. SRAdb 通過 NCBI SRA數據 ...

Sat Sep 22 01:05:00 CST 2018 0 924
R下載和使用

R下載和使用: 在電腦網速正常的情況下,如果下載很慢或失敗,可能是連接到了錯誤的鏡像,可以更換鏡像嘗試。 # 1.通過菜單點擊安裝R # 1.1在R原生界面中安裝# 1.2在Rstudio中安裝 # 2.通過命令安裝R#### install.packages('ggplot2 ...

Wed Dec 09 19:36:00 CST 2020 0 720
[R語言]foreach和doParallel實現多個數據庫同時查詢

R語言在進行數據查詢時,每執行一條語句,都會阻塞。直到查詢語句返回結果之后,才會進行下一條語句。 為了能夠實現同時對多個數據庫進行查詢,以節省順序執行下來的時間,首先考慮通過多線程來進行數據查詢。 不過多數據庫同時查詢,多個結果合並起來過大的話,本地機器的內存可能是一個風險點,心里要對 ...

Tue Apr 12 01:10:00 CST 2016 0 2065
R自帶數據包

datasets(R自帶數據包) 作者:王彥博 作品來源:百度百科 precip #長度為70的命名向量 euro #歐元匯率,長度為11,每個元素都有命名 landmasses #48個陸地的面積,每個都有命名 rivers #北美141條河流長度 state.abb #美國50 ...

Wed May 31 04:27:00 CST 2017 7 425
R/Bioconductor下載和安裝,升級

R:基本(自動加載)和推薦(安裝R時也會下載,但需要手動加載),拓展(其他,手動加載)。 安裝好的將被放在一個指定的目錄下。這個目錄被稱為庫(Library)。當需要使用到某一個的時候,通過運行library()函數來加載軟件,其過程就是到庫中去尋找需要加載的軟件,並將 ...

Sun Jul 02 20:15:00 CST 2017 0 2406
keil mdk 支持下載目錄

C:\Users\Administrator\AppData\Local\Arm\Packs\.Download 可以在這里把已經下載拷貝走,以便日后安裝時節約時間 ...

Fri May 08 22:18:00 CST 2020 0 769
Python·下載的第三方目錄

閱文時長 | 0.0分鍾 字數統計 | 8.8字符 主要內容 | 1、引言&背景 2、聲明與參考資料 『Python·下載的第三方目錄』 編寫人 ...

Wed Jun 02 08:27:00 CST 2021 0 1071
GWAS 匯總數據庫大全

簡介 本文匯總一些常見的GWAS summary數據鏈接(定期更新) 一、GWAS匯總數據庫(全表型) 1.IEU OpenGWAS:包含42,484 個GWAS摘要數據集的214,725,223,303 個遺傳關聯的數據庫 2.PheWeb: 包含Biobank Japan,以及UKB ...

Fri Jan 21 17:57:00 CST 2022 0 14065
 
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