GO富集分析
GO的主要用途之一是對基因組進行富集分析。例如，給定一組在特定條件下上調的基因，富集分析將使用該基因組的注釋發現哪些GO術語被過度表示（或未充分表示）。 富集分析工具 用戶可以直接從GOC網站的主頁進行濃縮分析。此服務連接到PANTHER分類系統 ...
原文：GO富集分析 信號通路
基因富集分析是分析基因表達信息的一種方法，富集是指將基因按照先驗知識，也就是基因組注釋信息進行分類。 信號通路是指能將細胞外的分子信號經細胞膜傳入細胞內發揮效應的一系列酶促反應通路。這些細胞外的分子信號 稱為配體，ligand 包括激素 生長因子 細胞因子 神經遞質以及其它小分子化合物等。 富集性分析應用范圍非常廣，從Disease Ontology,Gene Ontology, KEGG, 到 ...
2019-07-29 14:43 0 1069 推薦指數：
相關推薦
GO KEGG富集分析繪圖
柱狀圖 讀取數據 轉換term為因子 設置柱子顏色 繪圖(柱狀圖) 繪圖（氣泡圖） ...
GO 和 KEGG 的區別 | GO KEGG數據庫用法 | 基因集功能注釋 | 代謝通路富集
一直都搞不清楚這兩者的具體區別。 其實初學者搞不清楚很正常，因為它們的本質是相通的，都是對基因進行歸類注釋的數據庫。 建議初學者自己使用一下這兩個數據庫，應該很快就能明白其中的區別。 以下以一個 ...
GO富集分析柱狀圖
...
使用clusterProfiler進行GO富集分析
使用clusterProfiler進行GO富集分析原創weixin_43569478 最后發布於2018-11-05 10:06:43 閱讀數 12741 收藏展開歡迎關注微信公眾號《生信修煉手冊》! clusterProfiler是一個功能強大的R包，同時支持GO和KEGG的富集分析 ...
DAVID 進行 GO/KEGG 功能富集分析
何為功能富集分析？ 功能富集分析是將基因或者蛋白列表分成多個部分，即將一堆基因進行分類，而這里的分類標准往往是按照基因的功能來限定的。換句話說，就是把一個基因列表中，具有相似功能的基因放到一起，並和生物學表型關聯起來。 何為GO和KEGG？ 為了解決將基因按照功能進行分類的問題，科學家們開發 ...
基因探針富集分析（GSEA）& GO & pathway
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.html GO是Gene Ontology的簡稱，是生物學家為了衡量基因的功能而而發起的一個項目，從分子功能（molecular function）、生物學過程（biological process ...
ggplot2 GO富集分析條形圖
參考博客 http://blog.sciencenet.cn/blog-3406804-1166293.html 四個參數用於控制坐標軸與作圖區域的位置 scale_x_discrete( ...