原文:R包MetaboAnalystR安裝指南(Linux環境非root)

前言 這是代謝組學數據分析的一個R包,包括用於代謝組學數據分析 可視化和功能注釋等眾多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代謝流程,安裝這個包出現了問題,於是我折騰了一上午。 這個包的介紹在:https: github.com xia lab MetaboAnalystR,安裝確實還比較復雜,依賴的東西太多太多。廢話不多說,記錄下安裝歷程。 安裝過程 首先最好是已經安裝了自己的R版本 非root , ...

2019-07-17 16:01 0 775 推薦指數:

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[Linux]rootR環境被conda破壞后如何恢復?

記錄說明 這篇文章本來是用來記錄Linuxroot環境安裝PMCMRplus折騰過程,但后來試過了各種方法安裝不上這個R后,我換上了Miniconda來安裝。經前人提醒,一開始安裝Miniconda我是沒加入環境變量的。但一直激活不了虛擬環境,所以后來我又加入了環境變量試着安裝,結果這一 ...

Tue Oct 15 06:59:00 CST 2019 0 477
linuxroot用戶下安裝軟件,搭建生產環境

之前的用實驗室的服務器,因為某些原因,使用的用戶沒有root權限。linuxroot用戶很多軟件無法安裝,非常的不方便。我的方法是使用brew來代替系統的包管理工具。brew是最先用在mac上的包管理工具,可以將所有的托管在user本地的環境內。下面的文檔中運行的時候記得將用戶名改成 ...

Wed Sep 18 00:40:00 CST 2019 0 717
Linux環境root用戶安裝Python3

安裝python-3.8.1: 系統環境:Centos 7 在python官網上下載相應的Linux版本:https://www.python.org/downloads/source/。這里首先安裝Python-3.8.1,下載,解壓: 創建安裝目錄 ...

Sun Aug 02 00:08:00 CST 2020 0 1004
Linux環境RR安裝及其管理

前言 R對windows使用很友好,對Linux來說充滿了敵意。小數據可以在windows下交互操作,效果很好很棒。可是當我們要處理大數據,或者要在集群上搭建pipeline時,不得不面對在Linux上裝R及想要的R這個難題,尤其是對root用戶而言更是艱難重重。 准備依賴庫 依次安裝 ...

Thu Jun 06 22:57:00 CST 2019 0 9730
Linux 互聯網環境安裝依賴

1 介紹 有的生產環境是沒有網絡的,我們部署rpm的時候會出現缺少很多rpm的依賴問題,都去網上下載實在太麻煩,今天介紹一個辦法可以解決這一問題。 2 解決方案 找一台可以聯網的機器,在上邊下載相應的rpm。 使用命令: #yum install ...

Fri Jul 12 21:10:00 CST 2019 0 600
linux root 用戶安裝redis 安裝

1,在Linux環境上下載gcc,通過源碼安裝得通過cc編譯器進行安裝。這時候得下載gcc。這時候使用root用戶進行安裝。 yum -y install gcc 2,接着編譯需要使用jemalloc。得下載jemalloc 編譯。使用yum安裝得添加一下倉庫源。改完倉庫源,這時候 ...

Tue Mar 03 05:45:00 CST 2020 0 3654
linux下子用戶(root安裝python

1、源碼安裝python > cd /home/username/ > wget https://www.python.org/ftp/python/3.6.8/Python-3.6.8.tgz > tar -xzf Python-3.6.8.tgz > cd ...

Fri Mar 12 09:10:00 CST 2021 0 256
 
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