原文:Linux環境下R和R包安裝及其管理

前言 R對windows使用很友好,對Linux來說充滿了敵意。小數據可以在windows下交互操作,效果很好很棒。可是當我們要處理大數據,或者要在集群上搭建pipeline時,不得不面對在Linux上裝R及想要的R包這個難題,尤其是對非root用戶而言更是艱難重重。 准備依賴庫 依次安裝:zlib bzip liblzma pcre curl,注意順序和版本。目前 . 以上 . 以下R版本相對較 ...

2019-06-06 14:57 0 9730 推薦指數:

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LinuxR環境安裝

R環境的兩種安裝方式,源碼編譯安裝和yum在線安裝 第一種:源碼編譯安裝 1.首先,從官網上下載3.5.0版本 2.下載完后記得解壓,我的習慣是解壓在/usr/local下面 tar -zxvf R-3.5.0.tar.gz 3.然后,安裝各種依賴環境 yum install -y ...

Tue May 07 05:54:00 CST 2019 0 7131
RMetaboAnalystR安裝指南(Linux環境非root)

前言 這是代謝組學數據分析的一個R,包括用於代謝組學數據分析、可視化和功能注釋等眾多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代謝流程,安裝這個出現了問題,於是我折騰了一上午。 這個的介紹在:https://github.com/xia-lab/MetaboAnalystR,安裝確實還比較復雜 ...

Thu Jul 18 00:01:00 CST 2019 0 775
linuxR安裝時退出狀態為0

經常由於linux版本較低,R版本較高,安裝最新的R時候會出現退出時狀態不是0,我安裝一個sparklyr,得到錯誤信息如下: Warning messages:1: In install.packages("sparklyr", dependencies = T ...

Fri Apr 28 04:47:00 CST 2017 0 6642
R(三): R原理及安裝

(package)是多個函數的集合,常作為分享代碼的基本單元,代碼封裝成可以方便其他用戶使用。越來越多的R正在由世界上不同的人所創建並分發,這些分發的R,可以從CRAN 或 github 上獲取,由於向 CRAN 提交審核非常嚴格,有些開發者並沒有將自己開發的R提至CRAN ...

Tue Aug 16 06:51:00 CST 2016 0 2723
linux系統中安裝R

1、查看R版本 2、啟動R 3, 測試data.table 4、安裝data.table 鏡像列表:https://cran.r-project.org/mirrors.html 5、測試 ...

Tue Feb 02 08:23:00 CST 2021 0 456
Linux 之改變R安裝路徑

Linux 之改變R安裝路徑 背景 linux服務器不同節點安裝R默認安裝在自己的R路徑的library,每個節點都有類似的安裝路徑,不同節點之間R不能共享。 問題 不同節點如何共用R,省去重復安裝R痛苦。 方法 除增加環境變量方法外,如果想長期使用自己設定的路徑 ...

Mon Apr 06 01:52:00 CST 2020 0 1267
R安裝以及安裝

今天看論文,需要用到R語言的庫,於是又折騰了半天.. 其實並沒有什么太大的問題,只是在第三方的下載方面還有python中使用R方面遇到了問題: 第三方的導入 其實在網上有很多的方法了,R安裝 先說結論:最推薦直接使用install.packages ...

Thu Mar 05 03:05:00 CST 2020 0 753
 
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