用R的igraph包來畫蛋白質互作網絡圖 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape
igraph語法簡單，畫圖快速。 Cytoscape專業，個性定制。 最終效果圖： 當然也可以用Cytoscape來畫。 參考：Network visualiza ...
原文：PPI | protein-protein interaction | 蛋白互作分析 | gene interaction | 基因互作
前言 做RNA seq基因表達數據分析挖掘，我們感興趣的其實是 基因互作 ，哪些基因影響了我們這個基因G，我們的基因G又會去影響哪些基因，從而得到基因調控的機制。 直覺確實是很明確的，但是細節處卻有很多問題。 我們討論的到底是基因表達的互作，還是基因產物的互作 對於蛋白編碼基因，它翻譯產生蛋白，如果此蛋白不參與轉錄過程，理論上不可能會影響另一個基因的表達，那也就不存在基因表達的互作的，它們的基因表 ...
2019-05-15 13:34 0 3059 推薦指數：
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