SAM/BAM文件處理
當測序得到的fastq文件map到基因組之后，我們通常會得到一個sam或者bam為擴展名的文件。SAM的全稱是sequence alignment/map format。而BAM就是SAM的二進制文件(B取自binary)。 那么SAM文件的格式是什么樣子的呢？如果你想真實地了解SAM文件 ...
原文：SAMTOOLS使用 SAM BAM文件處理
怪毛匠子 整理 samtools學習及使用范例,以及官方文檔詳解 第一步：把sam文件轉換成bam文件,我們得到map.bam文件 system samtoolsview bSmap.sam gt map.bam 第二步：sort一下BAM文件,得到map.sorted.bam system samtoolssortmap.b ammap.sorted 第三步：創建一個關於bam的索引文件,我們 ...
2018-12-27 09:35 0 6697 推薦指數：
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