amber模擬kcl水溶液
最近剛開始學習amber軟件，看網上的教程勉強知道怎么操作這個amber了。就暫時跑了個分子動力學，其他的啥也沒處理。先把我的操作過程記錄下來吧，免得日后忘記。其實和其他的分子動力學軟件的操作大同 ...
原文：VMD-水溶液中注入離子
VMD中默認中性溶液不添加任何離子，故以下操作可加入指定數目的離子。 .建水盒子：VMD Extensions Modeling Add Solvation Box .填寫水盒子參數：如下 . 加入離子：完成第二步建成水盒子后，會自動生成solvate.pdb 和solvate.psf文件，有三種加離子方式，后文有對應詳解。VMD Main操作：Extensions Modeling Add io ...
2018-12-21 15:28 0 802 推薦指數：
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