原文:RNA提取和建庫流程對mRNA-Seq的影響

RNA提取和建庫流程對mRNA Seq的影響 已有 次閱讀 : 個人分類:轉錄組測序 系統分類:科研筆記 關鍵詞:轉錄組測序,RNA Seq,,鏈特異性RNA Seq,轉錄組文庫構建,總RNA提取 RNA seq,轉錄組測序,鏈特異性RNA Seq,轉錄組文庫構建,總RNA提取 目前RNA Seq是挖掘不同生長時期及不同脅迫條件下 不同組織細胞中其差異表達基因通常所采用的研究方法,同時還可以鑒定 ...

2018-11-10 16:08 0 1580 推薦指數:

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RNA-seq技術 | RNA sequence library construction

為什么必須了解技術? 轉錄組有哪些分類? 有哪些常見的RNA-seq技術?各有什么特點 活體真核細胞里有哪些RNA,各自有什么功能,占比多少? PCR對RNA-seq影響?PCR free是什么意思? 為什么RNA-seq總有一部分reads無法比對到轉錄組? RNA-seq ...

Sun Jul 05 02:38:00 CST 2020 0 1728
RNA-seq簡單處理流程

RNA_seq pipline RNA_seq pipline PeRl 2018年3月7日 首先說明一下我做RNA-seq處理流程的文件樹格式: RNA-seq/ data ...

Sun Mar 11 02:27:00 CST 2018 0 2961
Seq數據分析流程RNA

文章目錄 RNA-seq 數據分析流程 相關軟件安裝 下載數據 sra轉fastq格式 數據質控 數據質控,過濾低質量reads,去接頭 比對 ...

Wed Jul 07 02:14:00 CST 2021 0 216
RNA-seq 基本分析流程

高通量測序技術,就是二代測序,已經成為現代生物學研究的一個較為常規的實驗手段。這一技術的發展極大地推動了基因組學,表觀基因組學以及翻譯組學的研究。RNA-seq 通過測定穩定狀態下的RNA樣品的序列來對RNA樣品進行研究,從而避免了許多之前研究手段的不足,比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知識 ...

Wed Feb 27 02:20:00 CST 2013 2 14247
ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 數據分析流程

補充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程,雖然可以完成任務,但是數據量一多,批次多起來,就非常難管理。 既然別人提供了這么好的流程,那就要用起來,管理起來不是一般的輕松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安裝比較麻煩,沒有針對local的一鍵安裝 ...

Tue Dec 10 17:57:00 CST 2019 0 1272
上傳RNA-seq數據到NCBI GEO數據 | 單細胞RNA數據上傳

SRA - NCBI example - NCBI 要發文章了,審稿時編輯肯定會要求你上傳NGS測序數據。 一般數據都是放在集群,不可能放在個人電腦上,因為有的數據大的嚇人(幾個T)。 所以我們就一個文件夾,然后把所有需要的fastq文件鏈接到這個文件夾就行了(copy太慢,也太占空間 ...

Wed May 30 00:58:00 CST 2018 0 6106
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
上傳RNA-seq數據到NCBI GEO數據 | 單細胞RNA數據上傳

上傳RNA-seq數據到NCBI GEO數據 | 單細胞RNA數據上傳 SRA - NCBI example - NCBI 要發文章了,審稿時編輯肯定會要求你上傳NGS測序數據。 一般數據都是放在集群,不可能放在個人電腦上,因為有的數據大的嚇人 ...

Tue May 26 21:44:00 CST 2020 0 1220
 
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