tophat cufflinks cuffcompare cuffmerge 的使用
Cole Trapnell said： there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cufflinks2) assemble each bam and cuffcompare them ...
原文：使用Tophat+cufflinks分析差異表達
使用Tophat cufflinks分析差異表達 : : 使用TopHat Cufflinks的流程圖 序列的比對是RNA分析流程中核心的一步。序列的比對，或者說是字符串的比對本身就是計算機科學中的一個經典問題，在生物信息學中更加頻繁的出現。序列比對中的錯配，插入 缺失可以識別出樣本和基因組之間的多態性，甚至可以找出腫瘤樣本中的gene fusion。而map到沒有注釋的基因可能是新的編碼基因， ...
2018-11-09 22:17 0 2756 推薦指數：
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