轉錄組分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用
轉錄組分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 轉載▼ 標簽： 生物信息學 轉錄組 1.Hisat2建立 ...
原文：HISAT2+StringTie+Ballgown安裝及使用流程
HISAT StringTie Ballgown安裝及使用流程 年Nature Methods上面發表了一款快速比對工具hisat，作為接替tophat和bowtie的比對工具，它具有更快的比對速度和更高的比對率，最近把這個流程走完一遍，感覺優勢還是很明顯的。一 HISAT ： 下載安裝：hisat 下載地址：ftp: ftp.ccb.jhu.edu pub infphilo hisat down ...
2018-11-09 21:51 0 3946 推薦指數：
相關推薦
HISAT2,StringTie，Ballgown處理轉錄組數據
HISAT2,StringTie，Ballgown處理轉錄組數據 本文總閱讀量次2017-05-26 HISAT2,StringTie，Ballgown處理轉錄組數據思路如下： 數據質控 將RNA-seq的測序reads使用hisat2比對 samtools ...
【轉錄組】使用hisat2+stringtie組合進行轉錄組定量分析
轉載於：https://www.ivistang.com/articles/312 准備軟件和數據 安裝miniconda wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda ...
HISAT2 下載和使用
HISAT2官網https://daehwankimlab.github.io/hisat2/ HISAT2 下載 https://daehwankimlab.github.io/hisat2/download/ Binaries Version: HISAT2 2.2.1 ...
StringTie
StringTie 參考鏈接：https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual#input 參數簡介 StringTie的基本用法： stringtie <aligned_reads.bam> [options ...
gulp安裝及使用流程
1. 安裝nodejs 去 https://nodejs.org/en/下載安裝文件安裝即可。 安裝完成后，在終端輸入node -v回車打印出nodejs的版本號，說明nodejs安裝成功。 在終端輸入npm -v回車打印出npm的版本號，說明npm也安裝成功(node ...
轉錄本組裝軟件StringTie的使用說明
轉錄本組裝軟件StringTie的使用說明 StringTie 轉錄本組裝軟件StringTie的使用說明 轉錄組分析流程 HISTA + StringTie 組合。其Protocol 發表在Nature Protocol ...