StringTie是約翰·霍普金斯大學計算機生物中心開發的一款轉錄組組裝軟件,在組裝轉錄本的完整度,精度和速度方面都較以往的cufflinks 有很大的提升,也是目前有參考基因組轉錄組主流的組裝軟件。 軟件的下載 StringTie 使用說明:新版本更新之后去掉了一些參數 ...
轉錄本組裝軟件StringTie的使用說明 StringTie 轉錄本組裝軟件StringTie的使用說明 轉錄組分析流程 HISTA StringTie 組合。其Protocol 發表在Nature Protocol 上 Transcript level expression analysis of RNA seq experiments with HISAT, StringTie and Ba ...
2018-11-09 21:38 0 3753 推薦指數:
StringTie是約翰·霍普金斯大學計算機生物中心開發的一款轉錄組組裝軟件,在組裝轉錄本的完整度,精度和速度方面都較以往的cufflinks 有很大的提升,也是目前有參考基因組轉錄組主流的組裝軟件。 軟件的下載 StringTie 使用說明:新版本更新之后去掉了一些參數 ...
轉錄組分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 轉載▼ 標簽: 生物信息學 轉錄組 1.Hisat2建立 ...
1.1.1 chrony簡介 Chrony是一個開源的自由軟件,它能保持系統時鍾與時鍾服務器(NTP)同步,讓時間保持精確。 它由兩個程序組成:chronyd和chronyc。 chronyd是一個后台運行的守護進程,用於調整內核中運行的系統時鍾和時鍾服務器同步。它確定計算機增減 ...
轉載於:https://www.ivistang.com/articles/312 准備軟件和數據 安裝miniconda wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda ...
軟件使用說明書 一、 軟件概述 本軟件面向所有大學生,旨在為用戶提供便捷的購買二手書的途徑和出售二手書的平台。 二、 軟件功能 本次發布版本為測試版本,只開放部分功能,敬請諒解。目前可以使用的功能有 a) 用戶注冊和登陸功能 b) 實現圖書搜索功能 c) 實現 ...
高通量測序數據下機后的原始fastq文件,包含4行,其中一行為質量值,另外一行則為對應序列,我們都了解高通量的數據處理首先要進行質量控制,這些過程包括去接頭、過濾低質量reads、去除低質量的3’和5’端,去除N較多的reads等,而針對高通量測序數據的質控軟件也有很多,在這里給大家介紹一款“老牌 ...
1.引言 1.1編寫目的 本手冊是軟件工程概論團隊項目《一起》的Alpha版使用說明,面向的對象群體為全校師生。 1.2項目背景 本項目由《軟件工程概論》課程需求創建,軟件由SmartCoder團隊開發維護 1.3參考資料 ...
關於換屆 網頁端使用說明 登錄方式 社團信息的修改 新聞的錄 ...