用“limma”進行差異表達分析
1.概述 矩陣 函數 表達矩陣 lmFit 分組矩陣 eBayes 差異比較矩陣 topTable 2.讀取表達矩陣： 得到表達 ...
原文：簡單使用limma做差異分析
簡單使用limma做差異分析 Posted:五月 , Under:TranscriptomicsBy Kaino Comments 首先需要說明的是，limma是一個非常全面的用於分析芯片以及RNA Seq的差異分析，按照其文章所說： limma is an R Bioconductor software package that provides an integrated solution f ...
2018-11-09 21:34 0 713 推薦指數：
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目錄 1. 加載表達矩陣 2. 創建樣本分類表 3. 加載limma包，構建如下矩陣 4. 規定哪一組數據與哪一組數據比較 5. 獲取差異表達數據 6. 導出差異表達數據 1. 加載表達矩陣 2. 創建樣本分類表 獲得類似 ...
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test.txt:文件格式： gene TCGA-3M-AB46-01A-11R-A414-31 TCGA-3M-AB47-01A-2 ...
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