原文:K-mer分析

.基本參數 基因組大小:G Read讀長:L 總Read條數:n r .鹼基深度分布 單條Read測序覆蓋到某一個鹼基的概率:L G 因為L G很小,n r很大,每個鹼基覆蓋深度服從泊松分布。 則每個鹼基的覆蓋深度的期望為:d n L G n r . K mer深度分布 假設基因組對K是unique的,可以得到G個不同的K mer。 單條Read測序覆蓋某個K mer的概率: L K G 同樣因 ...

2018-11-03 01:52 0 2392 推薦指數:

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