使用 gffread 提取基因組序列信息
需求：提取 1 號染色體的 21856782-21856982 和 43942666-43942866 區間的 fa 序列； 需要准備的test.gff3文件如下所示，第一列是染色體號，第二列和第三列的內容隨意，第四列和第五列是提取的開始位置和終止位置，第六列和第八列內容隨意，第七列是基因組的正負 ...
原文：不同的方法從gtf中提取相關基因組信息in R
Method One: library GenomicRanges library GenomicFeatures library annotatr makeTxDbFromGFFtxdb lt annotatr::makeTxDbFromGFF gff file, format gtf GRanges txdb ebg lt transcriptsBy txdb, by seqlevels an ...
2019-03-11 15:19 0 933 推薦指數：
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