AnnotationHub, clusterProfiler 進行GO，KEGG注釋
1⃣️ AnnotationHub 目前最新的工具包叫做AnnotationHub，顧名思義，就是注釋信息的中裝站。通過它，能找到了幾乎所有的注釋資源。如果沒有，你還可以根據已有的數據用它提供的函數進行構建。 1. 加載AnnotationHub library(AnnotationHub ...
原文：GO | KEGG的注釋是怎么來的？
但凡是做過基因表達數據分析的 芯片 RNA seq，scRNA seq ，肯定是跑過基因集功能注釋和通路富集的，因為它是研究未知基因集的利器。 但跑過之后老板肯定會給反饋，通常得到的注釋都是沒有太多意義的，偶爾能隨緣得到一些滿意的注釋，所以常見的注釋數據庫是有顯而易見的缺點的。 而往往我們是在驗證時才使用注釋，這種拿不准確數據來驗證新的數據的方法確實值得思考。 那么GO和KEGG常見注釋庫到底有些 ...
2018-08-07 12:02 0 2592 推薦指數：
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